En Bolivie, c'est l'Espagne qui représente la France pour la délivrance de visas de court séjour Schengen.
Toutefois, les Instructions consulaires communes (relatives à la délivrance des visas) disposent, au point II.1.2.e: "- la représentation ne vaut qu'en matière de délivrance de visa. Si le visa ne peut être délivré du fait que l'étranger n'est pas en mesure de fournir les preuves suffisantes qu'il satisfait aux conditions, l'étranger doit être informé de la possibilité d'introduire sa demande auprès d'une représentation de carrière de l'État de destination principale,"
En conséquence, le consulat d'Espagne n'est pas compétent pour refuser un visa et aurait dû informer votre belle soeur de la possibilité de présenter une demande de visa auprès de l'ambassade de France.
Je conseille donc à votre belle soeur de prendre contact avec l'ambassade de France.