1. La carte de séjour française autorise la circulation sans visa dans l'espace Schengen. Comme vous n'avez pas cette carte de séjour, vous n'êtes pas autorisée à circuler sans visa à ce titre, ni en Allemagne (aéroport de Frankfurt, ni en Rque tchèque).
Toutefois, les ressortissants mexicains sont dispensés de l'obligation de visa de court séjour pour entrer dans 'espace Schengen et y effectuer des séjours de moins de 3 mois.
Le problème est de savoir si le séjour que vous avez déjà effectué en France est comptabilisé dans ces 3 mois.
Et là, les positions des Etats Schengen divergent et dépendent des accords bilatéraux de dispense de visa conclus par le Mexique avec chaque Etat.
Certains Etats schengen estiment que cette période passée en France doit être comptabilisée (Allemagne, mais pas dans tous les cas!) et d'autres estiment que cette période ne doit pas être comptabilisée (Rque tchèque).
Je vous conseille donc de prendre contact avec les consulats allemands et tchèques pour vous assurer de leur position.
2. Quand vous prenez un vol Paris-Frankfurt-Prague, vous n'êtes jamais en zone internationale C'est un vol intérieur Schengen. Il n'y a pas de contrôle d'immigration, comme pour un vol Paris-Lyon-Toulouse.